Łaskami Słynącej Figury Matki Bożej, Figura gotycka Madonny z Dzieciątkiem została wyrzeźbiona w XIV wieku w Szkole Artystów Krakowskich. Była ona przeznaczona dla Biecza. Biecz z kolei przeznaczył Figurę dla parafii Męcina Wielka. Po ustaniu parafii łacińskiej w Męcinie Wielkiej Figura została przeniesiona przez katolików do Lipinek. Stało się to w XVI wieku.
W Lipinkach Figura przebywała w trzech kolejnych kościołach. Pierwszy - drewniany był pod wezwaniem św. Marcina i stał pośrodku wsi już za czasów Jana Długosza. Dziś w tym miejscu stoi kapliczka zbudowana z kamieni pochodzących z fundamentów tamtej świątyni (zdjęcie obok). Drugi kościół, murowany, powstał dzięki fundacji właściciela wsi hrabiego Jana Wielopolskiego w 1624r. Był on p.w. Matki Boskiej Wniebowziętej. Do dziś stojący wybudował w latach 1780-83 ówczesny właściciel Lipinek hrabia Andrzej Ewaryst Kuropatnicki. W tym ostatnim Figura przebywała do 2005 roku.
W 1911 r. od Lipinek odłączyła się Wójtowa i została erygowana jako samodzielna parafia. W 1972 roku miał miejsce pożar kościoła - Spłonęła Łaskami Słynąca Figura Matki Bożej. W tym samym roku zrekonstruowana, została ukoronowana koronami Papieskimi 17 sierpnia 1980 roku. Świątynia nosi tytuł bazyliki, który przeniesiony został z poprzedniego kościoła (przeniesienie na zasadzie ludowej). Na terenie sanktuarium są jeszcze dwie cerkwie greko-katolickie w Rozdzielu i Bednarce. Jest także Dom Pielgrzyma wraz z częścią zakonną SS. Dominikanek.
W latach 1995-2005 z inicjatywy ks. proboszcza Wacława Śliwy i wysiłkiem parafian zbudowana została drugą świątynia w centrum wsi Lipinki. 15 sierpnia 2005 r., w uroczystość WNMP, figura Matki Bożej w procesji została przeniesiona ze starego kościoła do nowo wybudowanej świątyni będącej wotum wdzięczności dla Maryi za srebrny jubileusz koronacji i nieustanną opiekę od ponad 500 lat. W ten sposób nowy kościół zyska rangę sanktuarium. Uroczystej Mszy św. pontyfikalnej przewodniczył bp Kazimierz Górny.